骨科

lncRNA和mRNA在成骨细胞分化过程中的差异表达分析

作者:伊文 来源:MedSci梅斯 日期:2018-05-20
导读

         长链非编码RNA(lncRNA)正在成为影响代谢组织发育、信号传导和功能的重要控制因子。然而,关于lncRNA在小鼠成骨细胞分化中的功能和概况知之甚少。本研究中,研究人员分析了从新生小鼠颅骨前成骨细胞样细胞以两天为间隔获得的18天的RNA测序(RNA-Seq)数据集。

关键字:  成骨细胞 

        长链非编码RNA(lncRNA)正在成为影响代谢组织发育、信号传导和功能的重要控制因子。然而,关于lncRNA在小鼠成骨细胞分化中的功能和概况知之甚少。本研究中,研究人员分析了从新生小鼠颅骨前成骨细胞样细胞以两天为间隔获得的18天的RNA测序(RNA-Seq)数据集。

        在成骨细胞分化过程中, 4058个mRNA和3948个lncRNA差异表达,根据模糊c均值聚类的表达模式将它们分为12个聚类。使用加权基因共表达网络分析,研究人员确定了9个与早期分化阶段(第2-8天)相关的模块和7个与晚期分化阶段(第10-18天)相关的模块。基因本体论和KEGG途径富集分析显示,在晚期分化阶段上调的mRNA和lncRNA与骨生成高度相关。最火,研究人员还鉴定了72个mRNA和89个lncRNAs作为潜在的标记物,包括用于成骨细胞分化和活化的几种新标记物。

        综上所述,该研究为小鼠lncRNA研究提供了有价值的实验基础,并提高了我们对小鼠成骨细胞分化生物学的理解。

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